1979年10月，经省编委会批准，成立黑龙江省人防工程设计科学研究所，隶属省人防办领导;1989年正式更名为黑龙江省人防设计研究院（以下简称“设计院”）。设计院经过40年的不懈努力，已成为我国人防行业的骨干技术力量。
设计院具有国家建设部颁发建筑行业（人防工程）甲级设计资质及建筑工程乙级设计资质、国家人民防空办公室颁发的人防设计甲级资质、国家发改委颁发的工程咨询（建筑）甲级资质；设计院下属企业黑龙江省人防监理工程公司具有人防工程监理甲级资质；现为勘察设计协会人民防空与地下空间分会理事单位、国家人防信息情报网会员单位、黑龙江省工程咨询协会会员单位。
设计院在职人员49人。在岗技术人员47人，其中高级工程师15人（含注册师6人）。机构设置为总工室、设计一室、设计二室、经营室、咨询室、办公室六个科室。建筑、结构、采暖通风、给水排水、电气、建筑经济、计算机等专业人员配备齐全，其中具备注册防护工程师资格的人员已达23人。
设计院主业为人防工程设计，随着人防工程的防护理论和施工技术的日益更新，设计技术也在不断的创新和发展。为适应各类工程建设的需要，也为在行业竞争中始终占有优势，设计院经过多年的技术培训和人才储备，已拥有一批全国人防设计人员，在人防指挥所等专项工程设计和平战结合人防工程设计水平上居于全国领先地位，推动设计院屡创佳绩。
多年来，设计院坚持效率、质量完成各项设计、咨询、科研任务。积极参与黑龙江省各地市人民防空建设规划编制，各类大、中型人防工程的可行性论证，人防指挥所建设和研究工作，哈尔滨地下轨道交通兼顾人民防空要求建设等，积累了丰富的人防建设经验，为黑龙江省地下空间合理有序开发和建设做出了较大贡献，提供了强有力的技术支持，已成为黑龙江省人防建设中一支不可或缺的专业技术队伍。